Integrating microbiome and metabolite population data for discovery of novel antibiotics
Independent Research Fund Denmark
Unknown
Antibiotika-resisten er ved at blive et udbredt problem, uden simple løsninger og med store potentielle økonomiske og menneskelige omkostninger. En løsning kunne være at identificere nye antibiotika, som bakterier endnu ikke er resistente over for. Den klassiske strategi til at identifcere nye antibiotika er besværlig og kandidater har ofte problemer med bivirkninger. I dette projekt vil vi istedet drage fordel af de store mængder af data der er genereret fra menneskelige fæces prøver, da molekyler her må antages at have været til stede i kroppen uden at skade værten. Ved hjælp af medborgerforskning har university of San Diego lavet et datasæt med observationer af både bakterier og molekyler med en størrelse der gør man ved hjælp af statistiske metoder kan finde bakterier der aldrig optræder på samme tid, og hvilke molekyler der kunne mediere denne negative interaktion. Ved hjælp af dette kan man finde organismer der kan isoleres og producere et molekyle.
Postdoc / DFF-International Postdoc / fellowship